El sistema de obturación se refiere a una boya calibrada a una densidad que no flota en los hidrocarburos, y que en cambio flota en el agua. Esto permite que cuando existe un gran vertido o existe una gran acumulación de hidrocarburo, la boya obture la salida del efluente y no permite salida del líquido. Este hecho, hace subir el nivel del liquido en el separador, hasta que llega a la altura del depósito de recogida y se vierte hidrocarburo en el. Una vez se ha vertido hidrocarburo, la boya vuelve a subir de nivel y permite otra vez el paso de liquido. También puede instalarse sin depósito de recogida de hidrocarburos tapándole rebosadero lateral. En este caso, la obturación sirve para asegurar que una vez lleno de hidrocarburo, este no será vertido y se tendrá que realizar un vaciado manual.
El sistema de obturación es muy aconsejable en todas las instalaciones debido a la seguridad que el sistema conlleva. Las administraciones competentes en temas de medio ambiente empiezan a exigir su instalación en la totalidad de los equipos. Los separadores de hidrocarburos con coalescencia, permiten la agrupación de pequeñas gotas de hidrocarburos, acelerando su separación y consiguiendo un rendimiento superior al de los equipos simples. Este equipo, es aconsejable siempre que se quiera asegurar un tratamiento con un mayor rendimiento.
